Em geral você deve incluir nos custos fixos, todos aqueles gastos que se repetem, seja mensalmente ou mesmo em outro período como anualmente. Por exemplo, aluguel, telefone, água, luz, salário da secretária, CRO, impostos de funcionamento, etc. Quanto mais custos fixos você incluir, maior será a precisão do seu preço final. O valor para cada custo fixo deve ser o gasto mensal com aquele custo por exemplo, o salário da secretária deve ser incluído integralmente, já o gasto com CRO, como o valor é pago anualmente, deve ser dividido por 12 e o resultado deve ser incluído como custo fixo mensal referente àquele gasto. Você faz uma reserva mensal para poder sair de férias uma vez por ano? Então divida seu salário por 12 e adicione esse valor como custo fixo. Isso também vale para os encargos trabalhistas dos seus funcionários, como Férias e 13º salário.